ปัญหาปวดไหล่เป็นปัญหาแทรกซ้อนที่พบได้บ่อยในผู้ป่วยอัมพาตครึ่งซีก เกิดจากกล้ามเนื้อรอบข้อไหล่อ่อนแรงลงจนไม่สามารถพยุงข้อไหล่ได้ ข้อไหล่จึงหลุดออกจากเบ้า ทำให้เอ็นรอบๆข้อไหล่ถูกยืดออกจนเกิดอาการอักเสบตามมา ร่วมกับการเคลื่อนไหวของข้อไหล่ในลักษณะที่ไม่เหมาะสมทำให้หัวกระดูกของต้นแขนและสะบักขาดการเคลื่อนไหวที่สัมพันธ์กันทำให้เนื้อเยื่อรอบข้อไหล่ถูกบดเบียดจนเกิดการบาดเจ็บขึ้น

ข้อไหล่หลุด
เกิดจากการที่กระดูกต้นแขนเคลื่อนออกจากเบ้า พบได้บ่อยในผู้ป่วยอัมพาตครึ่งซีกที่อยู่ในระยะอ่อนแรง เกิดจากแรงดึงของน้ำหนักแขนในขณะผู้ป่วยนั่งหรือยืนแล้วแล่อยให้แขนห้อยตกลงมา

Shoulder hand syndrome
เป็นกลุ่มอาการที่ทำให้ปวดไหล่อย่างรุนแรงและมีการติดของข้อไหล่ตามมา มีอาการบวมและปวดของข้อมือตามมาร่วมกับความผิดปกติของการหดและขยายตัวของหลอดเลือดบริเวณแขนและมือ ผู้ป่ยมีอาการมือบวม ร่วมกับปวดหัวไหล่ร้าวลงมือ